Analyse d'Images
Notre laboratoire dispose d’équipements et d’expertises uniques pour l’analyse par imageries microscopiques avancées des maladies du système nerveux.
Equipe
Resp. Scientifique. Marc Dhenain
Acquisition d’Images
Afin d’acquerir des images de données histologiques, notre plateau dispose de
Microscopes optiques
° Un microscope à fluorescence (Olympus XI)
° Un microscope à fluorescence LeicaS
Scanners à lame
° Un scanner à Lame Leica Aperio Versa
° Un scanner à lame basse résolution
Analyses d’Images
Ce plateau réalise des analyses qualitative et quantitative des données microscopiques des tissus humains et des modèles de pathologies et des thérapies développés dans le laboratoire.
Activités
° Quantification synaptiques lors de maladies neurodégénératives
° Analyses stucturelles de cellulles (analyse de sholl, reconstruction 3D)
° Analyse d’images confocale time-lapse pour quantifier la migration des cellules de schwann
Equipements
En fonction des besoins expérimentaux
° Des stations de travail pour analyse d’images
° Des tablettes Wacom pour segmenter des régions d’intérêt
° Différents logiciels sont mobilisés pour des tâches telles que l’acquisition d’images en mosaïque, la détection automatisée d’objets par seuillage, le comptage stéréologique de cellules ou l’analyse tridimensionnelle des images.
- Logiciel ImageJ/FIJI https://imagej.net/software/fiji/downloads
- Logiciel QuPath https://qupath.github.io/
- Logiciel Imaris
Accès
Ces équipements sont disponibles à des utilisateurs externes sur demande, généralement dans un cadre de collaboration scientifique. Les projets soumis sont évalués par une commission scientifique composé d’experts en différentes technologies d’imagerie. Contact: Marc.Dhenain@inserm.fr